Para ordenar as pastas de capítulos, que possivelmente pode ter sido desconfigurado.

Devemos com a tecla F8 selecionar as pastas que devem ficar em ordem:

Segure as pastas selecionadas, e arraste para baixo da linha de criação:

Outra opção para ordenar as pastas, é clicar com o botão direito do mouse em cima do nome da sua obra, onde vai ter a opção ordenar linhas de composição:

Por ultimo, indo no menu arvore > Reconstruir Arvore: